關於曹操安葬的地點，後人也提出了不同的見解。一種說法認為，曹操陵位於銅雀台正南5公里的靈芝村。乾隆五十二年(1787年)寫成的《彰德府志》上就明確標著，魏武帝陵在靈芝村，而在其南，緊鄰著甄後的朝陽陵。甄後，即曹丕之妻甄文昭。她原為袁紹二兒子袁熙之妻。曹操打敗袁紹進入鄴城後，曹丕捷足先登，入袁府，見其美貌絕倫，遂納之為妻。後甄氏失寵，被曹丕賜死，葬於鄴城。
曹操之墓為何與其兒媳墓連在一起呢?這中間還有些故事呢。原來，曹操在攻打袁紹之前，早已聽說了甄氏的美貌，但其子曹丕捷足先登，作為父親，怎能奪兒子之美呢?再說，曹操和袁紹同輩，若娶其兒媳為妻，豈不貽笑於天下!
雖然甄氏被兒子娶走，但做父親的還是念念不忘。曹操與甄氏的關係還真有些微妙，至於二人是否有私情，不敢妄加斷語，但從一些現象分析，似乎能找出點線索來。
《後漢書·孔融傳》中寫道：孔融系名門出身，為孔子二十世孫，自少譽滿清流，為人恃才傲物，最後被曹操所殺。這其中最重要的原因是因為孔融給曹操寫了一封信。在信中，他嘲笑曹丕納甄氏乃是「武王伐紂，以妲己賜周公」。曹操未解其意，詢問之。孔融答曰：「以今度之，想當然耳。」這「侮漫之辭」，揭了曹操家醜，因為曹操一向以周文公自詡。曹操聽了這話，認為孔融是在講自己，所以盛怒之下，孔融人頭落地。
還有一個根據，即是曹丕的表現。曹丕娶甄氏時，是十分喜愛的，但曹操一死，馬上就冷落了她。據《魏書》記載，甄氏對曹丕的新寵說了一些不滿的話，曹丕知道了甚為震怒，對其百般虐待，最後又下詔書，賜之以毒酒，令她自殺。甄氏不喝毒酒，曹丕的新寵妃子郭氏就用糠塞於其口，趁其喘息之時，強行灌下毒酒，將其害死。另外，曹操死後，曹丕將其父的妃嬪全部召來，供自己玩樂。一次曹丕生病了，其母卞太后前去看望。她掀起門簾一看，見曹丕床側坐著的女子都是曹操生前的貼心宮妃。太后驚奇地問：「這些人何時被召到你房中來的?」曹丕回答：「父親剛死，我就召她們來了。」說話時臉上毫無羞愧之色。卞太后見此情形，氣憤地說：「你這樣做，死了連狗鼠都不吃你!」
從這兩點看，曹操似乎與甄氏有曖昧之情，所以才導致了孔融之死和曹丕的報復。也許，正是因為曹操的這段醜事，清朝的學究們才故意將兩個人的墳墓繪製在了一起。當然，這僅僅是一種大膽的假設，並無事實根據。
另一種說法認為，曹操陵在其故里譙縣的「曹家孤堆」。
1991年第5期《風景名勝》雜誌上刊載了一篇題為《魏武故里話曹操》的文章。文章認為，曹家孤堆即是曹操陵，其理由有三：
其一，《魏書·文帝紀》載：「甲午(220年)，軍治於譙，大饗六軍及譙父老百姓於邑東。」《亳州志》載：「父帝幸譙，大饗父老，立壇於故宅前，樹碑曰大饗之碑。」曹操死於該年正月，二日入葬，如果是葬於鄴城的話，那曹丕(魏文帝)為何不去鄴而返故里?說明曹丕此行目的是為了紀念其父曹操。
其二，《魏書》還說：「丙申，親祠譙陵。」譙陵就是曹氏孤堆，位於城東20公里處。曹操31歲時曾返鄉在此建築了精舍，而曹丕也於187年生於此處。所以曹丕祠譙陵，其意有二，一不忘所生之地，二祭先王之陵。
其三，亳州有龐大的曹操宗族墓群，其中包括曹操祖父曹騰墓，其父曹嵩墓等，曹操長女曹憲墓也在此處發現，綜上可知，曹操之陵亦當在此。
但是這種說法紕漏甚多。其中一個明顯的錯誤是，把曹丕的幾次祭祀作為證明曹操之陵在亳州的證據。其實，歷代皇帝的祭祀，並不見得只是祭父，更多的是祭祖，如明太祖朱元璋做了皇帝後，派懂得風水的大官到其出生地泗州選址，為其高祖、曾祖、祖父造陵，所以曹丕之於祠譙，只是一種祭拜祖先的活動，並不能證明曹操墓即在此處。至於曹家祖墳在此，曹操之墓也必在此的說法就更顯得蒼白無力了。
面對「曹墓不知何處去」的尷尬局面，後人不由得發出了「生前欺天，死後欺人」的感歎，而對曹操為人之奸詐也有了更為深入的認識。其實，這只是問題的一個方面。從另一角度看，曹操一生節儉，力主並親身實踐「薄葬」，這在歷史上無疑是具有積極意義的。曹操所處的時代，戰亂頻仍，社會動盪，其採用隱秘的辦法處置後事，也是迫不得已。而且這種辦法，不僅保護了自己，也使諸多的盜墓賊無從下手，一次次徒勞無功，從這個意義上講，曹操又是十分明智的。
從曹操入葬至今，時光已流逝了一千多年，曹操的真正陵寢還沒有找到蹤跡，也許人們是永遠找不著了。