縱觀三國歷史我們可以看得出，諸葛亮的軍事才能高出司馬懿一籌，但是在政治上諸葛亮不如司馬懿。諸葛亮為報劉備之恩只盡心盡力為漢室打天下。而司馬懿卻能夠取曹而代之，最後統一六國，成就就不可謂不小。
兩人都有自己的長處。總的來說還是司馬懿厲害。首先我們要看他們各自的志向，諸葛亮之志是賢能之臣，司馬懿之志是代魏另立。從志向上來，當然是司馬懿更厲害。
政治上，諸葛亮很早跟隨劉備，盡展其才能，宇內無人不知諸葛大名。但司馬懿是個聰明人，他要為自己之志向而奮鬥，那就要既不過分沉默，也不高調，低調了會被皇帝所棄，高調了會被皇帝所忌，所以司馬懿在政治上採取蟄伏，尋機，做人做事均低調的策略，特別是在曹操時代。到了曹丕，曹睿時代，司馬懿才開始漸露崢嶸。
軍事上，我認為二人差不多，只是用兵方略不盡相同。
諸葛偏重攻，司馬偏重守。還有重要一點，那就是性格，司馬懿沉穩，諸葛亮持重，司馬懿忍辱，諸葛亮負重，司馬懿善出奇，諸葛亮惟謹慎。
諸葛亮事事謹慎，少有奇兵，目光深遠，艱苦治國，司馬懿奇中有慎，伏中待機，目光深遠，忍功驚人，從這方面說，諸葛的性格是能幹實事，司馬的性格是能幹大事。也是司馬佔上風了。
以靜治動，司馬懿深知計謀不如諸葛亮，便選擇了靜。任其攻打，任其羞辱，任其變化，穩坐釣魚台。為何靜可治動，為何靜贏，因為動者自毀心智。
諸葛亮輸給司馬懿到不如說輸給自己，輸給自己的短命，輸給自己的聰明。七擒孟獲，有七次但每個都是勝利。然而六出祁山，每個均是失敗。曾經戰功顯赫，萬人敬仰，如今六次無功而返。內心的浮躁，內心的挫敗感，加之長途奔襲，身心的折磨。最終諸葛亮將自己折磨而死，命送五丈原而司馬懿的等待終見成效。
司馬懿可謂忍辱負重之奇才，笑納巾幗之辱。眾怒而其不怒，並平息眾怒安撫軍心，等待諸葛亮的死亡。說謀略重要然謀略輸給人性，說人性重要但需和謀略結合。諸葛亮與司馬懿上演了一場靜與動，謀略與人性，之間的惡戰。
究其失敗的原因，還是因為諸葛亮的實力不如司馬懿，評介謀略贏取勝利。然當無計可施之時，比拚的是實力。軍事實力，統帥的健康，士兵的鬥志。
明的悲哀在於雖有能力，而沒遇到好的主公
劉備太假,所以荊州沒早早拿下，影響了統一中國的進程；到後來剛愎自用地和吳國開戰,而且大敗,更把之前苦心積累的功業敗了..所以才說「遺恨失吞吳」。到後來，劉禪無能，白白揮霍了孔明的能力 。
曹操雄才,統籌能力、寫作能力都上乘，
唯一可惜的是，為人稍顯多疑，因此也沒遇到諸葛亮這樣大智慧的人。雖然有個司馬懿，內心卻不死心忠效於曹家，以致沒叮囑後人防範司馬一家。
如此看來，他們都沒有遇到真正有雄霸天下才略的對象，正統思想害了諸葛亮，曹操多疑，而且破壞了傳統儒者的正統觀念，於是二人沒走在一起。真是遺憾。
況且他們的目標本身就不一樣。曹操以統一天下為任，諸葛亮以輔佐明君為任，範疇不一，志向有別。