關於曹操殺華佗這件事，民間流傳著這樣一種說法：華佗給曹操治病，說要想治好病，必須開顱做手術;曹操一聽這話，以為華佗要殺害自己，所以就把華佗殺掉。由此得出結論，曹操殺華佗，是因為多疑。然而，這個說法是從小說《三國演義》中傳出來的，並不能當成史實。這不過是羅貫中編造的。
現在還流行一種說法，說華佗野心太大，仰仗自己高明的醫術，要挾曹操向他要官，所以曹操一怒之下把華佗殺掉。這種說法完全是臆想。華佗本是讀書人，古代的讀書人都以做官為榮，這沒錯，但華佗不是一個官迷：當年陳珪推舉華佗為孝廉，華佗辭而不就，因為他生逢亂世，不願為官。這樣一個人，怎麼會要挾別人給官。
那麼，曹操一向愛才、惜才，華佗又是神醫;既然如此，曹操為什麼會殺華佗?一個亂世梟雄，一個走方郎中，你打你的天下，我治百姓的病，明明可以井水不犯河水，相安無事，為什麼會有殺身之禍?歸根結底，是因為華佗的固執。
當時的情形是：曹操患了「頭風」病，請華佗醫治。華佗看了之後，說：「此近難濟，恆事攻治，可延歲月。」意思就是你這個病必須得長期治療。就在這時，華佗收到家書，於是借妻子病重為由，回家去了。幾日後，曹操請華佗治病，華佗卻不去了，說妻子還沒有治好。曹操派人暗中調查，發現華佗妻子並沒有生病。於是，曹操把華佗處死了。
在古代人的心目中，「上醫醫國，其次疾人」。作為一個讀書人，做官才會被人看得起，行醫治病不被人重視。
而華佗，是一個有夢想的人。作為一個飽讀詩書的讀書人，他本可以於廟堂之上做高官，而且有很多機會，但他拒絕了，他選擇了做一個郎中。當得知曹操的病情時，他明白，自己如果為他治病，就意味著要做曹操的侍醫，只為他一個人服務。華佗不願意，不甘心。他想做一個走方天下的郎中，為老百姓治病。直到進了監獄，華佗還堅持把自己的畢生所學寫下來，傳於後人。
華佗不願給曹操當侍醫。但是，在古代社會裡，醫生的社會地位並不高，郎中就是郎中，不管你是神醫還是庸醫，說到底都是奴才。奴才是沒有人格的，面對官家的命令，只能服從;不服從者，死。以曹操的地位，殺一個郎中就跟踩死一隻螞蟻一樣簡單，他並不把華佗當「人」看。
封建制度，維護的是統治者的利益，絲毫不會保護華佗這種普通人的生存權!曹操殺華佗是有罪名的，罪名是「欺騙罪」和「不從徵召罪」。所以，害死華佗的，是他的固執，和封建社會「萬般皆下品，惟有讀書高」的社會理念。